外向老实的高中生天童纯（小野贤章 配音）自幼生长在美丽温馨的京都，某天他突然遭到一个恶鬼的袭击，仓皇之中跑入一座古寺，失掉了僧人源云（中村狮童 配音）的救助。俄而竟被源云带到了久远的平安时代。原来平安时代恶鬼横行，与人类展开了连番的战争。为了消灭饿鬼，源云穿越时空带来了被称作救世主的天童。在最新的战役中，天童为救助同伴有意中唤醒了号称能摧毁恶鬼们的八岐大蛇。偶然的时机，他和大蛇救下了被贵族追杀的恶...

小智和皮卡丘等一行同伴在旅途中前行。某日，宝可梦波尔凯尼恩突如其来并自愿与小智锁在了一同。波尔凯尼恩与被人类损伤过的宝可梦们共同生活，因此十分厌善人类，但这条神奇的锁链却让他们无法分开，巧妙的故事就此末尾。小智与皮卡丘又将一同末尾新的冒险…… 另一方面，在超级机关城市阿佐特王国，大臣贾维斯失掉了终年追求的终极发明——500 年前降生于阿佐特王国的天然宝可梦玛机雅娜。听说在玛机雅娜体内，有被称为 “...

故事末尾为第一季故事的七年之后。　　高达模型对战的规则被改造，亦令其对战更受欢迎。　　虽然伊织诚和岭司失掉第7回敢达模型对战世界大赛的冠军，也令学校圣凤学园沾光不少。不过，其“高达模型对战部”就只剩下部长—国中部3年级先生·星野文奈一人。　　在新竞赛规则底下，假设要参与竞赛必需以3人1组的参与战役。而圣凤学园高达模型对战部郤由于人数缺乏的状况下难以出场。　　在偶然的之间，出现了一名转校生，就是跟随...