1999年，某个东西被卡车运出了馆山市。几天后，哥斯拉登陆了馆山，特生自卫队出动与之展开了苦战。在战役中，自卫队员家城茜（釈由美子 饰）不测害死了战友叶山二尉（森末慎二 饰），自己却幸运活了上去，并被派去了资料科。　　另一方面，日本政府在柘植真智子首相（水野久美 饰）的指挥下，召集了汤原德光（宅麻伸 饰）等迷信家末尾研讨对付哥斯拉的G兵器。他们以在馆山冲开掘出来的初代哥斯拉骨骼为基础，用了四年制成...