《光灵：武士之魂》是《光灵》的衍生作品，背景是同一个宇宙，但这回离开日本的幕府末期与明治时代之间，浪人伊藏与半兽人雷登并肩协作，护送拥有魔杖的精灵小女孩前往南方的精灵国度……...

在某个朔夜，犬夜叉一行和妖怪奈落展开最终决战。经过一番艰辛缠斗，他们终于消灭这个罪恶的妖怪，漫长的征战终于告一段落。戈薇持久回到现代休整，随后再次和犬夜叉、七宝踏上寻觅四魂玉碎片的旅程；法师弥勒的风穴消逝，他前往寺庙拜祭父亲；珊瑚则和云母四处寻觅漂泊的弟弟琥珀。　　安宁的日子并未继续太久，取得自在的神乐在神无的的指引下，见到被封禁在生命之镜中的神久夜。五十年前，在神久夜的力气下，大地堕入永世的月圆...