迷你墨王国的冤家们为欢迎亚瑟再次造访做着各种各样的预备，塞林娜公主也日夜期盼着他的到来，整个迷你墨王国弥漫着一片忙碌祥和的气氛。亚瑟（弗莱迪·海默 Freddie Highmore 饰）自从上一次的巧妙冒险之后，便不时希冀能再回到那个神奇的中央，希望能再次见到美丽的塞林娜公主和迷你墨王国更多的惊喜。可是爸爸却被蜜蜂惹恼了，他计划带着妈妈和亚瑟分开这个中央。亚瑟临动身前突然收到一只蜘蛛送来的写着“救...

延续前一集的剧情，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 David Schwimmer 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 Jada Pinkett Smith 配音）以及企鹅们，为了能分开马达加斯加岛回到五颜六色的纽约，对一架破旧的失事飞机停止维修正造，并成功下降。当大家曾经末尾庆贺终于可以...